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C57BL/6J小鼠
F0代构建:
RNVU1-18属于U1小核RNA(snRNA)的假基因。U1 snRNA作为核糖核蛋白(RNP)复合体的一部分,是剪接体的重要组成部分,负责pre-mRNA的剪接。U1 snRNA的5 '端和5 '剪接位点碱基对,位于内含子的5 '端外显子/内含子交界处,并定义了第一次分裂发生的位置。除此之外,U1 snRNA具有额外的生物学作用,包括:U1 snRNA与TFIIH复合体的cyclin H成分相互作用,并通过增强一般转录因子与蛋白编码基因启动子的关联来促进转录起始;当U1 snRNP与位于末端外显子下游的隐性5 ' s结合时,可以抑制多聚腺苷酸化;U1 snRNP也可以保护早期转录本免受发生在pre-mRNA转录本体内隐聚(A)位点的过早切割/聚腺苷酸化事件。在人类中,U1 snRNA基因是由位于1号染色体短臂上的多基因家族编码的。此外,大量的U1 snRNA假基因存在于整个基因组中。U1 snRNA假基因有三种不同的类型,它们由DNA和RNA介导的机制产生。其中U1 snRNA I类伪基因与U1 snRNA基因有相当多的5 '和3 '侧翼序列同源性,并与两个基本启动子元件,远端序列元件(DSE)和近端序列元件(PSE)保持良好的同源性。假基因定位于1号染色体长臂上的一个单独位置(1q12-21) 。经序列分析,RNVU1-18编码一种与U1 snRNA相同的snRNA,因此可能参与了U1 snRNA池的作用,这说明哺乳动物细胞中很大一部分的U1 snRNA可能来自于vU1 snRNA基因。
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