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F344大鼠
基因敲除构建设计
条件性Hbxip-Floxp采用PCR方式进行基因敲除的鉴定。
引物设计
引物名称
引物库
引物序列(5’-3’)
PCR 产物大小
跑胶检测loxp 插入情况
F1
R-CKO-G3-LOXP1-F
TGCATTGTTTGTGGCTTTGTG
KI 275 WT 241
R1
R-CKO-G3-LOXP1-R
ATTCTTCATTCTAATTTTGGGAGC
F2
R-CKO-G3-LOXP2-F
CTGCTACTAGCCTCCCTTTGG
KI 230 WT 196
R2
R-CKO-G3-LOXP2-R
TCTAAAGCCCTCTTCCAGACC
跑胶检测送大带测序
F
R-CKO-G3-F
GGAGGTCTTACAAGAAGACGCG
KI1 745 WT 1677
R
R-CKO-G3-R
CCAAGAGGCTCCCTCTGTTC
测序结果:黑色箭头代表野生型序列,红色箭头代表插入的序列,L 端和R 端测序的峰形分析,都可确认在1#大鼠floxp 序列(ATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTAT)精确插入指定位置。具体见图3。根据测序结果分析 Lamtor5-loxp条件性敲除大鼠构建成功。
图3. F/R 引物扩增的PCR 产物测序结果
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