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C57BL/6小鼠
一、模型设计原理:
GRNA介导Cas9蛋白剪切目标外显子两端的内含子DNA,同时提供同源模板Donor,基因组两端通过同源重组修复方式进行DNA修复,在特定外显子两端插入FloxP。Drd5-FloxP小鼠与组织特异性表达Cre小鼠交配,从而实现Drd5基因条件性敲除的目的。实验采用最新的spCas91.1进行注射,减少了基因组中的off-Target。
根据Drd5基因组结构和蛋白功能保守区分析可知:Exon2(aa1-478)为公共外显子,位于蛋白功能保守区上:7tm_GPCRs superfamily domain,条件性删除这个外显子后,将破坏7tm_GPCRs superfamily domain,蛋白失活。因此决定在Exon1的两边定点插入FloxP位点,实现将Exon1条件性敲除。
Drd5基因存在1种转录产物,见下图:
http://uswest.ensembl.org/Mus_musculus/Gene/Summary?db=core;g=ENSMUSG00000026496;r=1:180568924-180601254
1)GRNA靶点设计及活性检测
在要删除的Exon1外显子两端,设计gRNA靶点如下
靶点名称
靶点序列(标灰为PAM序列)
活性分析
Drd5-L1
GCGCGCTGCCGACAGGATCGG
10%
Drd5-L2
TCCCATCCTGGGGACTAGAGG
60%
Drd5-L3
GCAGGGTGAGCGCCCCTCGGG
40%
Drd5-L4
TGACCGTCCCCAGACCCGAGG
50%
Drd5-R1
TGTTCTGTGACTTGCACCTGG
95%
Drd5-R2
GAGTGGCAATTGCTGGTATGG
Drd5-R3
GCAGCAGCCCGAGAACAGGGG
85%
Drd5-R4
TTTCTCCCTGATTTGTTGTGG
Drd5-R5
CACTTTCTCGTCTCTAAAGGG
使用Cas9/gRNA靶点效率检测试剂盒(货号:VK007)进行gRNA体外活性检测,结果如下:
gRNA靶点活性检测结果
靶点活性数据分析如下:
根据活性检测结果,我们选用活性最高的L2,R1进行F0代首建鼠构建。
2)PCR结果分析
扩增说明
引物名称
引物序列(5’-3’)
PCR产物大小
使用如下引物进行目的条带扩增
两端floxp插入
F
CTGGGCTTGGGGCGAGGGTAT
KI-floxp:2564bp
测序
R
GAGAAACACTGAGCACCAACTG
WT:2496bp
M-CKO-M30(1-19,NC)目的带扩增琼脂糖凝胶电泳结果如下图:
M:BM2000 Marker,如右图所示
NC:阴性对照
如图所示,5♂扩出目的条带
3)Drd5floxp/flox小鼠测序结果分析
以M-CKO-M30-5小鼠测序结果为例,测序结果标注如下:
3’端FloxP比对结果:
WT:野生型对照 NC:阴性对照,如图所示,2#,4-6#,8#,11#,16#扩出双带
5♂xC57♀(1-9♂;10-18♀)用引物F/R扩增琼脂糖凝胶电泳结果如下图:
4)Drd5floxp/flox小鼠测序结果分析
将2#,4-6#,8#,11#和16#由引物F/R做PCR得到的产物送测序,测序结果分析2#,4-6#,8#,11#和16#小鼠均为两端精确插入floxp序列的杂合子。
5)Drd5心肌细胞可诱导性条件性基因敲除小鼠的繁育及鉴定结果:
Drd5floxp/flox小鼠与Cre 的小鼠(Myh6 CreERT2)杂交,对后代自交获得的小鼠进行基因型鉴定,成功获得Drd5心肌细胞诱导性条件性基因敲除小鼠Drd5myh6-creERT2)。见下图
M:Marker;3,4,5,6,8,9,10,11:Drd5flox/flox,Myh6CreERT2;1,2,5,7:Drd5flox/flox
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