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实验所用大鼠为SD(Sprague Dawley)背景。1925年由美国Sprague dawley农场用Wistar培育而成。特点是头部狭长,尾长接近身长,产仔多,生长发育比wistar快,抗病能力尤其对呼吸系统抵抗力强,自发肿瘤率低,对激素感受性高。该品系在国内使用频率高,价格相对便宜。
3.1 实验材料
3.1.1 实验动物
SD大鼠购自北京维通利华实验动物技术有限公司【SCXK(京)2012-001】。超排用雌鼠数量10-15只,年龄3周龄,交配传代用野生型SD大鼠为成年8-10周龄大鼠。实验中基因工程大鼠由本实验室繁殖产生。实验中涉及动物的操作程序已获得中国医学科学院医学实验动物研究所实验动物使用与管理委员会的批准,批准号为ZLF18003.
3.1.2实验仪器
仪器及耗材
生产厂商
NanoZoomer S60数字病理切片扫描仪
日本滨松光子学株式会社
激光共聚焦扫描显微镜
Leica
透射电子显微镜
JEOL
显微注射仪
Nikon
光学显微镜
化学发光凝胶成像系统
BIO-RAD
PCR仪
Realtime PCR仪
ABI
冰冻切片机
电泳仪
电泳槽
Tanon
数码凝胶图像处理系统
组织匀浆机
POLYTRON
恒温培养箱
温控振荡箱
Incucell
TAITEC
离心机
Eppendorf
摇床
SCILOGEX
塑料薄膜封口机
德清拜杰有限公司
电动鼓风干燥箱
天津市泰斯特仪器有限公司
电子称量器(量程0.5g-620g)
奥豪斯仪器(常州)有限公司
电子称量器(量程0.1mg-220g)
Sartorius
4℃冰箱
海尔集团
-80℃冰箱
SANYO
-20℃冰箱
涡旋振荡器
上海沪西分析仪器厂
移液器
MRI
西门子
PET/CT
3.1.3实验试剂
试剂
体外转录用试剂盒
Ambion
Taq DNA聚合酶
TaKaRa
T7 转录试剂盒
Invitrogen
T4 DNA裂连接
胶回收试剂盒
Qiagen
质粒提取试剂盒
Axygen
Trizol试剂
逆转录试剂盒
DNA提取试剂盒
北京全式金生物科技有限公司
MBP(MAB42282)抗体
R&D
GADPH
Santa Cruz Biotechnology
NC膜
Millipore
化学发光液
ImmunoCruz
蛋白质分子量标记物
Takara
蛋白酶抑制剂
罗氏
组织裂解液
Thermo
丽春红
Beyotime
BCA试剂盒
Westernblot洗液(10×)
30%Acr-Bis
SDS-PAGE电泳液
Western blot转膜液(粉剂)
TEMED
过硫酸铵
1.5 M Tris·HCl(pH=8.8)缓冲液
1 M Tris·HCl(pH=6.8)缓冲液
琼脂
BD公司
异丙醇
北京化工厂
脱脂奶粉
内蒙古伊利实业集团股份有限公司
3.1.4模型构建流程
利用CRISPR/Cas9技术制备MBP敲除大鼠。在MBP基因起始密码子之前插入Cre重组酶,来构建MBP-Cre大鼠(SD.MBP(tm-Cre)-GC/ILAS)。该模型与Cre报告大鼠进行杂交(SD.Rosa26(tm-imCherry)-GC/ILAS),可以检测MBP基因的表达图谱,同时通过杂合子交配的方式可以获得该基因敲除的纯合子大鼠,使用PCR方法进行基因型鉴定,使用Western blot技术进行蛋白水平敲除效率的鉴定。
3.1.5 MBP-Cre大鼠的建立
3.1.5.1 MBP-Cre大鼠模型的建立
图 1. MBP-Cre大鼠模型构建设计方案
靶点1:
R-Mbp-EA-gRNAup: TAGGTGCCCACCCAGCTGACCC
R- Mbp-EA-gRNAdown: AAACGGGTCAGCTGGGTGGGCA
GGCGCTTCTTTAGCGGTGAC AGG
R-Mbp-EB-gRNAup: TAGGCGCTTCTTTAGCGGTGAC
R- Mbp-EB-gRNAdown: AAACGTCACCGCTAAAGAAGCG
合成的sgRNA单链通过退火复性结合成小片段,插入BSA I线性化的载体,构建完成的sgRNA载体通过体外转录成为可注射的sgRNA。
3.1.5.2 动物繁殖和表达图谱分析
获得F0代后,首先通过与野生型大鼠进行杂交,进行基因修饰大鼠传代能力分析。该模型包含Cre重组酶,可以同时与Cre reporter大鼠(SD.Rosa26(tm-imCherry)-GC/ILAS,http://www.ratresource.com)进行杂交,得到imCherry/MHC-Cre大鼠,进行表达图谱分析。之后MBP-Cre大鼠通过杂合子与杂合子杂交,获得MBP-Cre纯合子大鼠,进行蛋白表达分析,并用于后续实验。
图2. MBP-Cre大鼠的繁育
3.1.5.3 鼠尾基因组DNA提取
在幼崽出生后剪脚趾标记,收集幼崽脚趾至1.5 mL EP管。然后参照DNA提取试剂盒(全式金)说明书按以下程序操作。
4.1MBP-Cre大鼠模型的建立
利用CRISPR/Cas9在MBP的起始密码子之前插入Cre重组酶元件。出生的小鼠经过设计的包含同源臂的引物(Table1),进行基因型鉴定,并进行插入序列的测序,最终获得了正确基因插入的大鼠图3-a所示。随后,我们通过杂合子杂交的方式获得了MBP-Cre双阳的大鼠,我们分析了1月龄大鼠体重和脏器发育相关指标,图3-b,c,d,e显示,双阳性大鼠在生长发育过程中,存在明显的生长停滞显现。各个脏器相比于野生型大鼠存在明显的减小。结果表明Cre的插入造成了的基因的突变。
随后我们进行了western blot表达分析,结果显示该基因的表达在大脑和脊髓中都没有表达图3-f所示,表明Cre的插入破坏了MBP基因的表达,该大鼠可以作为一个MBP敲除大鼠模型。
图3 MBP-Cre大鼠的建立
Table 1 本文中用于基因型鉴定的引物信息
Name
Sequence (5’-3’)
Amplicon
R-MBP-KI-upF1:
TCTACAGGTCAGTAATAGAGTTGGGAG
1988 bp
R-MBP-KI-upR1:
CTGTTTCACTATCCAGGTTACG
R-MBP-KI-dwF1:
TACTGACGGTGGGAGAATG
1472bp
R-MBP-KI-dwR1:
AGCCACCTGACACTAGTTACTGG
R-MBP-F1:
CAGCAGACCCAAAGAATAACTGG
470 bp
R-MBP-KOR1:
CAAATGTTGCTGGATAGTTTTTAC
240 bp
R-MBP-WTR1:
CTTTCTGCCAGTTAAACCCATAG
4.2MBP在大鼠脑组织中的表达分析
由于在该基因起始位置插入了Cre重组酶,该重组酶的表达利用MBP内源启动子,因此,Cre的表达能够代表MBP基因的表达图谱。我们通过将MBP-Cre大鼠与与Cre reporter大鼠(SD.Rosa26(tm-imCherry)-GC/ILAS,http://www.ratresource.com)进行杂交,得到imCherry/MHC-Cre大鼠,进行表达图谱分析。结果如图4所示,表明MBP在大脑中存在着非常特异的的表达图谱。
图4 MBP-Cre介导的mCherry表达图谱
4.3MBP敲除大鼠的出生情况统计
我们对该基因敲除大鼠的出生情况进行了统计,结果表明该基因敲除不影响生殖,通过杂合杂交的方式,敲除大鼠和野生型大鼠的出生比例基本一致,符合孟德尔自由分离和自由组合规律(Table 2所示)。
Table 2MBP敲除大鼠出生情况统计
No. of each Birth
No.of WT
No. of KO
No. of HET
19
6
8
5
15
4
12
2
13
3
18
7
9
22
1
10
139
41
40
58
WT:wild type; KO: knockout; HET:Heterozygous
4.4MBP敲除大鼠的生存率分析
上述结果表明我们成功建立了MBP敲除大鼠,并且该敲除大鼠表现为生长发育迟滞,后期伴随后肢瘫痪。随后我们对MBP敲除大鼠进行了生存率分析,图3-f所示,结果表明该基因敲除在40天左右开始出现死亡,在100天时死亡率到达80%以上。
4.5MBP敲除大鼠脑和脊髓中髓鞘相关蛋白的表达情况分析
我们对1月龄MBP敲除大鼠,进行脑组织和脊髓组织取材,分析了大脑和脊髓组织中髓鞘相关基因的表达情况。引物见Table 3所示,表达情况如图5所示。结果表明Plp1、Cnp、Pmp22在脑组织和脊髓组织表达都有明显降低。Mpz基因在脊髓中表达明显降低,但在大脑中表达反而升高,Mag的表达在脑中变化并不明显,但在脊髓中表现为表达降低。这样该基因的敲除小鼠存在一定的差异,表明该大鼠可以作为新的模型,与小鼠、人类该类疾病进行比较医学研究。
Table 3 Realtime PCR引物
R-plp1-RT-F1
CCAAATGACCTTCCACCTGT
115bp
R-plp1-RT-R1
CATGAGTTTAAGGACGGCAAA
R-pmp22-RT-F1
TGTACCACATCCGCCTTGG
138bp
R-pmp22-RT-R1
GAGCTGGCAGAAGAACAGGAAC
R-mpz-RT-F1
TGTTGCTGCTGTTGCTCTTC
103bp
R-mpz-RT-R1
TTGTGAAATTTCCCCTTCTCC
R-mag-RT-F1
ACAGCGTCCTGGACATCATCAACA
85bp
R-mag-RT-R1
ATGCAGCTGACCTCTACTTCCGTT
R-cnp-RT-F1
ATTTTGGCAAGAGACCTCCA
149bp
R-cnp-RT-R1
AAAGAGGGCAGAGATGGACA
图5 髓鞘相关蛋白在脑和脊髓中的表达情况分析
4.6MBP敲除大鼠行为学分析
MBP基因敲除后,在10日龄左右,开始表现出颤抖和运动平衡障碍,一直持续要死亡,或最后演变为多发性硬化。我们对1月龄大鼠进行了视频拍摄,具体如图6所示(视频)。我们并对月龄左右的敲除大鼠进行了运动能力的测试,如图7所示。
图6 MBP敲除大鼠运动视频
图7 MBP敲除大鼠的行为学检测
4.7MBP敲除大鼠MRI检测分析
对40天和60天的MBP敲除大鼠和野生型大鼠进行了MRI分析,如图8所示。T2-weighted数据显示,在胼胝体位置MBP敲除大鼠高于野生型大鼠。
图8 MBP敲除和野生型对照在40天龄和60天龄的MRI分析
4.8MBP敲除大鼠利用18F-FDG进行PET/CT影响分析
我们利用18F-FDG进行脑糖代谢能量标记,进行PET/CT分析,如图9所示。结果表明18F-FDG在下丘脑和海马中的吸收相比于野生型有明显的降低。
图9 18F-FDG进行脑糖代谢能量标记的PET和MRI影像图
北检检测技术研究院承诺:我们将根据不同产品类型的特点,并结合不同行业和国家的法规标准,选择适当的检测项目和方法进行分析测试,或根据您的要求进行试验分析。为了不断改进我们的工作,我们致力于提高产品质控分析、使用性能检测能力,并持续加强我们团队的科研技术。同时,我们将积极跟进新的技术和标准,以最大程度地满足您的需求和市场要求。